《寶可夢 晶燦鑽石》《寶可夢 明亮珍珠》的冒險舞台位於「神奧地區」。在這片綠意盎然的大地上，巍峨的天冠山聳立於中央，而且有諸多神話流傳下來。主角將探訪「神奧地區」內的各個地方，以成為寶可夢聯盟的冠軍為目標。
城鎮和道路等場地細膩地以《寶可夢 鑽石／珍珠》的尺寸重現。曾經遊玩過原作的人，能帶著回憶再次踏上熟悉的地方，重溫那段冒險之旅；初次來到神奧地區冒險的人，也將在這段旅途上遇到許許多多的邂逅和驚奇。
主角會從「草苗龜」「小火焰猴」「波加曼」之中挑選1隻寶可夢作為最初的夥伴，踏上冒險之旅。在《寶可夢 晶燦鑽石》的冒險旅途中，主角將遇見傳說的寶可夢「帝牙盧卡」，在《寶可夢 明亮珍珠》中，則會遇見傳說的寶可夢「帕路奇亞」。
